在下情况时，应选择手术切除扁桃体。

慢性扁桃体炎反复急性发作者    一年平均3次以上，或曾并发扁桃体周围脓肿者，在急性扁桃体周围脓肿期也可进行手术。

扁桃体重度肥大者     患者可以没有扁桃体炎，但因扁桃体过度肥大，堵塞咽腔，致咽腔狭窄，妨碍吞咽、呼吸、发声等，或引起阻塞性睡眠呼吸暂停综合征（因扁桃体肥大堵塞引起呼吸不畅，睡眠时舌根后坠更加重咽部堵塞，引起打鼾、憋气，甚至呼吸暂停）。

慢性扁桃体已成为引起体内其他脏器病变的病灶，如风湿性心脏病、关节炎、肾炎等。

白喉带菌者经保守治疗无效者。

各种扁桃体良性肿瘤，可连同扁桃体一同切除，对恶性肿瘤应慎重选择。